Predição de Estrutura de Proteínas
Predição de Estrutura de Proteínas
Bioinformática Aplicada às Proteínas
Se sua proteína não existe num banco de dados, você tem que modelá-la.
Aqui você vai aprender a modelar proteína por homologia, usando modelagem comparativa via MODELLER/PYTHON
SÃO 5 MÓDULOS DO BÁSICO AO AVANÇADO, TUDO PASSO A PASSO
NÃO SE PREOCUPE.
Para fazer o curso tenha um computador com Linux e noções em biologia molecular.
》Vídeos/aulas e minicursos passo a passo sobre modelagem comparativa PYTHON e algoritmos de bioinformática.
》Vídeos sobre o que são proteínas, aminoácidos, doenças amilóides, termodinâmica das proteínas, analisando dados de cristalografia e muito mais.
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O que é bioinformática?
》Algoritmos de Bioinformática e recursos computacionais. Informações, detalhamentos e aplicações:
BLAST,
NCBI,
MUTABIND2,
MODELLER,
Python,
BeAtMuSiC,
mCSM-PPI2,
JALVIEW,
CHIMERA,
PYMOL,
CSU,
GENBANK.
》Quiz avaliativo.
》Baixe/instale/atualize programas e pacotes para o curso - preferência o Linux - Baixe/instale/atualize: Gedit, emacs ou editor de sua preferência, Modeller, Python, Chimera, Pymol.
》Leitura - Compreensão teórica - O que é Bioinformática?
Porquê preciso modelar?
》Texto dissertativo - Preferência via Latex, okular.
》Leitura - Compreensão teórica - Introdução - Estrutura 3D de proteínas - Enovelamento de proteínas.
Qual método PSP usar para modelar?
》Leitura - Compreensão teórica.
》Introdução - Predição da estrutura - Modelagem comparativa.
Como buscar e escolher o melhor template para modelagem comparativa por PSP.
Alinhando com Clustal e Modelando com Modeller/Python